事件起因于广州市农业科学研究院选育的种子，由湖北瑞民农业科技有限公司负责销售。涉事种子包装袋上标注的生产许可证号属于广东华茂高科种业有限公司，但华茂高科表示并未生产Y系列品种，并计划采取法律行动以维护自身权益。真正的“Y两优602”生产资质属于广州乾农农业科技发展有限公司，但乾农科技否认涉事种子是其生产的产品。
根据中国种业信息网的信息，荆门市种子总公司的二级经销商透露，村民们购买的种子实际上是湖北瑞民分装的，产地为江苏盐城，这与包装上标注的广东不符。湖北瑞民被指控可能侵犯了生产许可证，或涉嫌假冒他人品种。
涉事种子包装袋上的许可证号属于华茂高科，但华茂高科的品种列表中并未包括“Y两优602”。华茂高科表示将针对湖北瑞民采取法律行动，怀疑其盗用其生产许可证。乾农科技虽然具有“Y两优602”的生产资质，但其许可证已过期，且乾农科技的官方网站显示，其产品仅在广东局部地区销售。乾农科技的经理齐经理推测，荆门的问题种子可能是由于当地对类似品种的需求较大，而非直接来源于公司。齐经理也否认问题种子直接来自公司。
经调查发现，“问题种子”可能并非产自广东，而是来自江苏盐城。荆门种子总公司和枝江种子管理局的工作人员确认了种子纯度存在问题，不符合国家质量标准。湖北瑞民的电话无法接通，警方透露，盐城的制种人员也已被逮捕。乾农科技的负责人确认，公司在江苏并无水稻制种基地。
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