PCR引物通常设计为与模板DNA的3'端互补，这样引物就可以在DNA复制过程中引导DNA聚合酶从5'到3'方向合成新的DNA链。这种设计确保了PCR反应的定向性和产物的准确性。
如果设计引物与模板DNA的5'端互补，那么PCR反应可能会无法成功进行，因为DNA聚合酶在合成新链时是从5'到3'方向移动的。这意味着引物需要与模板DNA的3'端配对，以便DNA聚合酶能够从引物的3'端开始合成新的DNA链。
在PCR过程中，引物与模板DNA的特定区域配对，从而定义了扩增片段的开始和结束位置。这使得PCR技术非常适合于特定DNA序列的检测和复制。
总结来说，为了确保PCR反应的有效性和特异性，引物应该设计为与模板DNA的3'端互补。这样可以确保DNA聚合酶在正确的方向上合成新的DNA链，从而产生准确的扩增产物。
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