DNA分子的两端分别被标记为3'端和5'端，这些标记是对DNA单链而言的。在DNA的单链中，磷酸基团连接的是脱氧核糖的第5号碳原子，因此被称为5'端。相对地，羟基（—OH）连接的是脱氧核糖的第3号碳原子，所以被称为3'端。每条DNA链的两端都具有这两个结构。
DNA是由多个脱氧核苷酸残基通过3'，5'-磷酸二酯键连接而成的长链分子。在大多数DNA分子中，存在两条这样的长链，它们以双螺旋的形式相互缠绕。然而，某些DNA分子可能是单链的，例如在大肠杆菌和噬菌体中观察到的DNA。此外，DNA分子的结构可以是环形的，也可以是线形的。
DNA的碱基组成在不同物种中各不相同，但是其中一个关键的特征是腺嘌呤（A）的数量等于胸腺嘧啶（T）的数量，而鸟嘌呤（G）的数量等于胞嘧啶（C）的数量。脱氧核糖是DNA的一个组成部分，它是核糖的一个衍生物，其特点是在第二个碳原子上没有羟基。它在细胞中扮演着至关重要的角色。
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