机关单位涉密人员管理制度主要包括涉密人员的界定与分类、资格审查与培训、岗位职责与权限、保密协议与责任追究，以及日常监督与管理等方面。
在涉密人员的界定与分类方面，制度需明确哪些岗位和人员涉及国家秘密，并根据涉密程度的不同，将涉密人员分为不同的等级，以便进行差异化管理。
资格审查与培训环节则负责确保涉密人员具备必要的政治素质、业务能力和保密意识。这通常包括入职前的背景调查、保密知识测试，以及定期的保密教育培训，从而确保他们能够胜任涉密工作并严守保密纪律。
在岗位职责与权限方面，制度应详细规定涉密人员的具体工作内容、权限范围以及操作流程。这有助于防止越权行为的发生，并确保涉密信息在传递和使用过程中的安全可控。
保密协议与责任追究是管理制度中的重要一环。通过与涉密人员签订保密协议，明确其保密义务和违约责任，可以在一定程度上约束其行为。同时，对于违反保密规定的行为，制度中也应明确相应的处罚措施和责任追究机制。
最后，日常监督与管理是确保涉密人员管理制度有效执行的关键。这包括定期的保密检查、不定期的抽查以及涉密人员的行为监控等，旨在及时发现和纠正可能存在的保密隐患，确保机关单位涉密信息的绝对安全。
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