疫情期间被隔离的员工单位是无权扣工资。在隔离期间，实施隔离措施的应当对被隔离人员提供生活保障;被隔离人员有工作单位的，所在单位不得停止支付其隔离期间的工作报酬。隔离措施的解除，由原决定机关决定并宣布。
一、在没有背离防疫基本规定的条件下，不论是因个人原因又或是其他个别原因，被强制隔离（比如：新冠肺炎确诊患者、病原携带者、疑似病例、密切接触人群）从而无法正常完成工作的员工，公司是需按正常出勤状态给员工发放疫情隔离期间的薪水。
二、若是不是被强制隔离的情况，而是封锁疫区、两地出行管控、待家隔离等其个别原因造成的隔离，其薪资的支付怎么处理？
1、隔离期可以工作。经公司与员工协商后，在隔离期可以通过电话、网络待家工作的，公司按照正常出勤状态发放工资。
2、在隔离期间不能居家办公，但安排了带薪休假的。员工与企业商榷后，员工可以隔离期间提前使用带薪假，公司需按照原来的假期规定分发工资。隔离天数超过原来规定的带薪假期天数的，则按照上面的第三种情况支付工资。
3、被隔离的期间内不能在家办公，且公司没有设置带薪假的。员工未到岗时间在一个月内的，公司按签订的劳动合同内的相关约定条款分发薪资；大于一个工资支付周期（即一个月）的，公司则改成支付生活费。各地生活费的标准也会各不相同，河南省是不低于当地最低工资标准的80%。
综上所述疫情期间被隔离的员工单位是无权扣工资建议积极维护自己的合法权益不要被欺骗
三、疫情期间用人单位可以辞退被隔离的员工吗
1、疫情期间用人单位是不可以辞退被隔离的员工。
2、疫情防控期间，员工受疫情影响，企业不得解除被隔离人员劳动合同，并且新冠肺炎患者、疑似病人、密切接触者在其隔离治疗期间或医学观察期间，不计入职工医疗期。
3、劳动合同履行期间，只有符合法定的条件和程序，即符合《劳动合同法》第三十九条、四十条、四十一条和四十二条规定，公司可以辞退员工。但对于生病正在治疗期间的劳动者，在法定医疗期内，非本人具有第三十九条规定的法定过错，不得辞退；医疗期满，不能从事原工作，也不能从事用人单位另行安排的工作的，提前30天书面通知或者额外支付一个月工资可以辞退。疫情影响不计入职工医疗期，不能辞退被隔离的员工。
法律依据：
《中华人民共和国传染病防治法》第四十一条
对已经发生甲类传染病病例的场所或者该场所内的特定区域的人员，所在地的县级以上地方可以实施隔离措施，并同时向上一级报告；接到报告的上级应当即时作出是否批准的决定。上级作出不予批准决定的，实施隔离措施的应当立即解除隔离措施。在隔离期间，实施隔离措施的应当对被隔离人员提供生活保障；被隔离人员有工作单位的，所在单位不得停止支付其隔离期间的工作报酬。隔离措施的解除，由原决定机关决定并宣布。
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