BRT快一线连接着第一码头和华侨大学，经过多个重要站点，包括开禾路口、思北、斗西路、二市、文灶、火车站、莲坂等。乘客可以在东芳山庄站换乘BRT3号线至会展中心，或者在机场站换乘BRT2号线至西柯。BRT快一线的运营时间为6:10至22:00，高峰时段每3分钟一班，平峰时段5至8分钟一班。
BRT快2线则从机场出发，经过凤林、侨英路口、天马路口、洪霞路口等站点，最终到达西柯。乘客可以在机场站换乘BRT1号线至第一码头或华侨大学。BRT快2线的运营时间为6:10至21:30，高峰时段每4分钟一班，平峰时段6至8分钟一班。
BRT快3线从第一码头出发，经过多个站点，最终到达前埔枢纽站，再继续前往会展北、会展南、文兴东路等。乘客可以在东芳山庄站换乘BRT1号线至华侨大学。BRT快3线的运营时间为6:10至22:30，高峰时段每3分钟一班，平峰时段5至8分钟一班。
BRT系统具有智能调度功能，遇大客流时会多开加班车，以满足市民的需求。建议乘客晚上提前进站，以免错过末班车。BRT实行一人一卡（票）制，E通卡按实际乘坐距离收费，“取整”则是现金购买的单程票。
链接线是收费的，E通卡0.3元，现金0.5元。BRT按公里计费，非空调期间3公里为一个基本里程，收取0.3元，之后每公里0.1元。空调期间，同样3公里为一个基本里程，收取0.3元，之后10公里内每公里0.2元，超过10公里每公里0.1元。
L1线设置在快速公交第一码头站，沿途包括轮渡、中山路步行街、海滨大厦、妇幼保健院等，乘客可转乘快速公交一号线、三号线或成功大道专线。
L2线设置在思北站，沿途包括大西洋海景城、湖滨西路好又多、天虹商场等。
L3线设置在斗西路口站，沿途包括市口腔医院、中山公园、园南小学等。
L4线同样从斗西路站出发，沿途可达十一中、市工商局、湖滨南车站等。
L5线从厦禾路出发，沿途包括普利大厦、白鹭洲公园、外国语学校等。
L7线从厦禾路出发，沿途可达银龙广场、皇达广场等。
L8线从厦禾路出发，沿途可达金榜公园西门、电化宿舍等。
L9线从莲前西路出发，沿途可达浦南新村、东坪山庄等。
L10线从莲前西路出发，沿途可达莲坂明发商业街、莲花中学等。
L11线从莲前西路出发，沿途可达禹州花园、忠仑公园等。
L12线从莲前东路出发，沿途可达瑞景新村西门、海悦山庄等。
L13、L14线从吕岭路出发，沿途可达金尚小区、后坑社东侧等。
L17、L18线从县黄路口出发，沿途可达安兜、马垅创业园等。
L21、L22线从嘉庚体育馆站出发，沿途可达霞梧、浒井等。
L25线从石村公交车场出发，沿途可达洪莲路和洪前路上的商场及周边小区等。
L26、L27线从前埔旧货城出发，沿途可达城市职业学院、前埔医院等。
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