伤寒的诊断依赖于流行病学资料、临床经过以及免疫学检查，但最终的确诊则需要找到致病菌。潜伏期通常为5至21天，时间长短与感染菌量相关。
在病程的第7至12天，部分患者会出现一种特殊的皮肤改变，即淡红色的小斑丘疹，也被称为玫瑰疹。这些疹子的直径大约为2至4毫米，施压时会褪色，略微凸出于皮肤表面，数量不多，通常不超过10个。它们会分批出现，主要分布在胸部和腹部，有时也会出现在背部和四肢。这些疹子通常会在2至4天内自然消退。
此外，一些出汗较多的患者可能会出现水晶型汗疹，也称为白痱，这是一种由于汗液不能顺利排出，汗液在皮肤表面积聚而形成的疹子。
值得注意的是，伤寒病容易复发，复发率大约在10%左右。在早期，当使用氯霉素作为特效治疗时，复发率曾一度上升到20%。患者在发热症状消失后的1至3周内，可能会再次出现临床症状，但通常比初次发作时要轻微（少数情况下可能会更严重），病程持续1至3周。此时，血液培养可能会再次检测到阳性结果。
复发通常只发生一次，二次复发的情况较为罕见，极少数情况下可能会有三次或以上的复发。复发的原因可能与机体免疫力下降有关，体内的病灶巨噬细胞中的伤寒杆菌重新繁殖并进入血液循环，再次引发菌血症。
复发现象多见于抗生素治疗不充分的患者。因此，确保充分的治疗对于防止复发至关重要。
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