两种植物的区别在于外型不同，叫法不同，分布不同等。1、外型不同：黑枣是属于柿科植物，果实近球形或椭圆形，成熟时蓝黑色，常附着白色薄蜡层。君迁子是柿科柿属高大落叶乔木植物，小枝为褐色或棕色，平滑或有黄灰色柔毛；叶片为椭圆形至长椭圆形；花为红色或淡黄色。
2、叫法不同：黑枣是熏制的红枣，属于枣类；君迁子是民间俗称黑枣、软枣、牛奶枣、野柿子、丁香枣。
3、分布不同：黑枣广泛分布于我国北方农村地区，尤其是河北、山东、山西比较多，其他地区如安徽、湖北、河南、四川、陕西一带都是零星分布，多为野生，少有人工种植的；君迁子在河北、山东、山西比较多，其他地区如安徽、湖北、河南、四川、陕西一带都是零星分布，多为野生，少有人工种植的。
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