目前养殖污水排放相关国家标准有《污水综合排放标准》、《畜禽养殖业污染物排放标准》、《农田灌溉水质标准》。浙江省、山东省和广东省已制定了畜禽养殖业污染物排放地方标准。
我国于1996年发布了《污水综合排放标准》（GB78—1996），规定了69种水污染物最高允许排放浓度及部分行业最高允许排水量，其中与养殖污水有关的污染物指标及其限值如下表所示。
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污染物一级水质二级水质三级水质BOD5（毫克/升）300COD（毫克/升）500SS（毫克/升）400NH+4-N（毫克/升）—P（毫克/升）—硫化物2.0氰化物1.0Cu2.0Zn5.02001年我国针对养殖污水排放制定了《畜禽养殖业污染物排放标准》（GB18596—2001），主要污染物及限值见下表，但是该标准实施已10余年，而且随着社会发展和人们对环保问题的重视，该标准已经不能满足生产和环保要求，目前正在修订中。浙江省、山东省和广东省分别于2005年、2005年和2009年发布了畜禽养殖业污染物排放地方标准DB33/593—2005、DB37/534—2005、DB44/613—2009，这些地方标准根据当地的环保新形势，对养殖污水排放提出了更高要求，这些标准的各项排放参数限值均比GB18596—2001更低。
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污染物指标标准值BOD5（毫克/升）150COD（毫克/升）400SS（毫克/升）200NH+4-N（毫克/升）80TP（毫克/升）8.0粪大肠菌群（个/毫升）10000蛔虫卵（个/升）2.0养殖污水除了达标排放外，也可经过适当处理后作为灌溉用水用于农业生产，此时，可参照《农田灌溉水质标准》（GB5084—2005）执行，该标准对灌溉稻田、旱地和蔬菜的水质分别提出了污染物的要求见下表。
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污染物稻田旱地蔬菜BOD5（毫克/升）40，15COD（毫克/升）100，60SS（毫克/升）60，15大肠菌（个/100毫升）000，1000蛔虫卵（个/升）2，1氯化物350铅0.2砷，铬0.1镉0.01汞0.001
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