当企业获得专为特定用途设计的财政拨款时，应当通过"专项应付款"科目进行会计处理。这个科目用于记录作为出资人投入的企业专项或特定用途的资金。专项应付款科目可以根据资本性投资项目进行详细记录。在实际操作中，企业收到拨款时，会计分录为借记"银行存款"，贷记"专项应付款-科研经费"。
当科研项目完成后，如果需要核销的部分，需要经过审批后，借记"专项应付款-科研经费"，贷记相应的费用或成本科目。对于拨款结余，如果需要退还，借记"专项应付款-科研经费"，贷记"银行存款"。如果结余不需退还，这部分资金则会转为企业的资本公积，借记"专项应付款-科研经费"，贷记"资本公积"。
专项应付款科目期末如果表现为贷方余额，意味着企业还有尚未转销的专项应付款。这个科目余额反映了企业对专项拨款的管理和使用情况。在财务报表中，这些处理方法有助于清晰地展现企业的财务状况和资金流向。
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