科员、副主任科员和主任科员在行政职务和工资方面存在着明显的区分。首先，它们都属于综合管理类的非领导职务，其中主任科员对应的是正科级，但并不是正科级别的领导职位，其地位略低于科长或乡镇长等实职正科级领导。
副主任科员的地位则为副科级，与科员相比，它象征着职位的进一步提升。通常，要晋升为副主任科员，需要具备副科职务至少三年的经验，而晋升为副主任科员则要求科员岗位服务满两年以上。
在公务员体系中，非领导成员，包括科员，其职务和级别范围是从十八级到二十六级。科员被视作基础工作人员，而非领导职务还包括了其他八个层级：巡视员、副巡视员、调研员、副调研员、主任科员、副主任科员，以及科员和办事员。因此，这些职位不仅体现在行政职务的不同，也反映了在组织中的层级和责任范围。
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