伺服电机的对齐方法多种多样，根据电机的不同类型和驱动器的功能，可以采用不同的策略。对于普通正余弦编码器，如果驱动器能够提供单圈绝对位置信息，可以通过直流电激励电机，调整编码器与电机轴的相对位置，使得编码器的C相信号与电机的UV线反电势波形过零点重合，实现对齐。若需进一步确认，可使用示波器再次验证两者过零点是否重合。
利用旋转变压器（旋变）对齐电机的方法则更为直接。首先，给电机UV绕组通以直流电，调整旋变转子或定子与电机轴的相对位置，直到旋变SIN信号包络幅值归零，锁定旋变位置。随后，通过观察SIN信号包络过零点与电机UV线反电势波形过零点是否重合来验证对齐效果。
若旋变驱动器提供与电机电角度相关的绝对位置信息，同样可以使用直流电激励电机，调整旋变轴与电机轴的相对位置，使显示的绝对位置值接近电机-30度电角度所对应的位置点，完成对齐。验证时，使用示波器观察SIN信号包络过零点与电机UV线反电势波形过零点是否重合，以确保对齐有效。
采用EEPROM等非易失性存储器记录旋变初始安装相位，可以简化对齐过程。具体步骤包括将旋变随机安装在电机上，固结旋变转轴与电机轴，用直流电激励电机，读取并存储旋变解析出的绝对位置值。此方法确保电机轴定向于电角度相位的-30度方向，存储的绝对位置值对应电机电角度的-30度相位。此后，驱动器将任意时刻解析出的与电角度相关的绝对位置值与存储值做差，并进行必要的换算，再加上-30度，得到电机电角度相位。
值得注意的是，采用EEPROM等非易失性存储器记录相位的方法需要伺服驱动器的支持。一旦对齐完成，电机与驱动器将绑定在一起，更换电机、旋变或驱动器均需重新对齐。
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