级别不同、任职不同、职责不同。
1、级别不同：教导员是、、、民兵、等队伍中设置的一级首长职务，全称为政治教导员，正营级，指导员是指连级单位以及中队的政工干部，是和连长、中队长平级的首长。
2、任职不同：教导员是营、派出所、交警大队教导员，指导员担任连队的党支部，连长等。
3、职责不同：教导员主要负责教育、培训和指导学生的日常生活和学习，帮助养成良好的学习和生活习惯，引导发展潜力和个性，指导员则更加注重对学生的职业规划和发展，以及对学生的专业知识和技能的指导和培训，帮助学生掌握实用的知识和技能，提高职业能力和竞争力。
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