α氨基酸和β氨基酸的主要区别在于氨基和羧基相连的碳链长度。
1、α氨基酸：氨基（-NH2）连接到与羧基（-COOH）直接相连的碳原子（也称为α碳原子）上。这个α碳原子上还连接有一个侧链R基团和一个氢原子。α氨基酸的立体结构中，除了甘氨酸外，α碳原子上的四个基团都不相同，且存在两种立体异构体，分别是L型和D型。在蛋白质中，除了甘氨酸，其他氨基酸通常都是L型的。
2、β氨基酸：氨基连接到与羧基相隔一个碳的碳原子上，即氨基连接在β碳原子上。这种氨基酸的命名中会包含“β”，以区分α氨基酸。
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