1、颜色：苔藓植物有叶绿体，不论是何种类群的苔藓，多数情况下都表现出不同程度的绿色，植株含水的状态下尤其明显，偶尔有棕色等特殊情况，也可以结合其他特征加以区别。而地衣在干燥状态下色泽上多少会有些发灰、发白，或者呈橙色、红色等鲜艳的颜色。
2、形状：苔藓植物有着类似种子植物根茎叶的结构分化，分别对应为拟根、拟茎和拟叶，看起来像是迷你版的盆景植物；而地衣虽然也可被大致划分为叶状地衣、壳状地衣和枝状地衣三大类，但形状上更像是缩微处理后的紫菜、海带或发菜，地衣在组织结构上的分化程度要较苔藓更为简单。
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