1、选择优质产品：市场上销售的多菌灵多为50%的可湿性粉剂和40%的胶悬剂无论选择哪种剂型，都应确保选用的是优质产品，并注意检查产品的有效期优选生产日期在一年内的产品，超过此期限的产品应根据情况适量增加使用量，而对于完全失效的产品则应避免使用。
2、控制药液浓度：在使用多菌灵拌料时，应严格控制药液的浓度，使用含量为50%的粉剂，按占料干重的0.1%的比例即可有效杀死和抑制杂菌生长盲目增大用量，不仅会增加成本，还影响菌丝的正常生长，甚至导致子实体的污染。
3、避免与碱性物质混用：多菌灵在碱性环境中容易分解失效，因此在拌料时不能与石灰等碱性物质同时使用，也不能将多菌灵与石灰的混合液长时间放置。
4、注意个人防护：由于多菌灵具有一定的毒性，因此在操作过程中应穿戴适当的防护装备，如防护手套、口罩等，以防止皮肤接触或吸入多菌灵溶液使用后需彻底清洗接触过药液的双手，避免药液接触到眼睛、口鼻等部位。
5、轮换使用杀菌剂：为避免杂菌产生抗药性，不长期使用多菌灵，可以与别的杀菌剂交替使用，以维持药效并延缓抗药性的产生。
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