可以通过软件调整。点击上端工具栏中的picture→atomdesign。原子的大小可以根据具体的实际情况在modelandradii中修改原子的半径，调节好原子之后，就需要添加多面体了，具体过程是：点击工具栏中的build→polyhedra→addpolyhedra，就能得到所示的对话框，然后我们想把钙设为中心离子，氧设为配位离子的多面体，具体过程就是centralatomgroup选中Ca,ligandatomgroup选中O，点击确定就能得到结果。这样调节厚街可以体现所展现出来的立体感了。
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