真核生物与大肠杆菌清除冈崎片段引物的方式不同的是清除引物的酶的不同。分别如下：
1、在真核生物中，DNA在副链上间歇性地停止并生成短的DNA序列片段，即冈崎片段。这些片段需要被清除以继续DNA的复制过程。真核生物中的RNA引物酶（RNaseH）能够识别并结合到杂交在冈崎片段末端的RNA引物，然后通过其5'-3'外切酶活性将冈崎片段降解，并形成完整的DNA双链。
2、在大肠杆菌中，DNA复制也会产生冈崎片段，但不同的是大肠杆菌中没有RNA引物酶。相反，大肠杆菌中的DNA聚合酶I（PolI）具有3'-5'外切酶和5'-3'内切酶活性。在复制过程中发现冈崎片段时，PolI会结合到冈崎片段末端，利用其外切酶活性去除冈崎片段上的引物，同时通过其内切酶活性在剩下的DNA上进行DNA合成，从而形成一个完整的DNA分子。
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