1、 区别：
农村合作医疗，也就是新农合。是由我国农民自己创造的互助共济的医疗保障制度，在保障农民获得基本卫生服务、缓解农民因病致贫和因病返贫方面发挥了重要的作用。新农合的具体保障内容，主要可以分为三块：门诊报销、住院报销、大病补偿。城镇居民医疗保险是以没有参加城镇职工医疗保险的城镇未成年人和没有工作的居民为主要参保对象的医疗保险制度。
2、城镇居民基本医疗保险起付标准和报销比例按照参保人员的类别确定不同的标准。一、学生、儿童。在一个结算年度内，发生符合报销范围的18万元以下医疗费用，三级医院起付标准为500元，报销比例为55%；二级医院起付标准为300元，报销比例为60%；一级医院不设起付标准，报销比例为65%。
二、年满70周岁以上的老年人。在一个结算年度内，发生符合报销范围的10万元以下医疗费，三级医院起付标准为500元，报销比例为50%；二级医院起付标准为300元，报销比例为60%；一级医院不设起付标准，报销比例为65%。
三、其他城镇居民。在一个结算年度内，发生符合报销范围的10万元以下的医疗费，三级医院起付标准为500元，报销比例为50%；二级医院住院起付标准为300元，报销比例为55%；一级医院不设起付标准，报销比例为60%。
拓展资料：
城乡居民医保有哪些保障责任
参保居民可享受普通门诊医疗待遇、门诊慢性病医疗待遇、住院医疗待遇（包括生育医疗待遇、新生儿医疗待遇）、重特大疾病医疗待遇。
1. 城乡居民医保住院医疗费用在医保目录范围内按标准报销，一年内最高报15万元。
2. 城乡居民患大病花费高额医疗费用在基本医保报销后，还可以享受城乡居民大病保险待遇，自己负担符合规定的住院费用超过1.5万元以上按以下标准再给予报销。
3. 城乡居民如果患有以下43种重特大疾病，其中住院病种33种、门诊病种10种，可以按规定享受城乡居民重特大疾病医疗保障待遇。即在指定的医疗机构就医，按限价标准报销，不设起付线；县级、市级、省级医疗机构住院的报销比例分别是80%、70%、65%；门诊腹膜透析的报销比例是85%，其他门诊病种报销比例是80%。
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