品牌授权不同，商品质量不同，店铺标识。
1、品牌授权不同，旗舰店是指商家在拼多多平台上以品牌名义开设的官方店铺，需要获得品牌方的正式授权。而普通店则不需要品牌方的授权，任何合法的商家都可以入驻。
2、商品质量不同，旗舰店所销售的商品需要保证品质，符合品牌方的质量标准。而普通店的商品质量则没有明确的要求，但拼多多平台会对商品进行抽检，确保商品质量符合平台规定。
3、店铺标识，旗舰店的店铺名称后面会带有“官方旗舰店”字样，以示与其他店铺的区别。而普通店则没有这样的标识。售后服务，旗舰店需要提供品牌方规定的售后服务，如七天无理由退换货等。而普通店的售后服务则由商家自行制定。
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