厌氧对动植物油去除率为85%。生化处理是废水治理的核心，去除废水中可降解有机污染物及NH3-N等营养型污染物。可以去除较多悬浮物和油脂类物质，可去除70%悬浮物和30%的动植物油。厌氧工艺适宜采用：升流式厌氧污泥床（UASB）或者水解酸化技术，COD去除率一般可达到85%以上；好氧处理适宜采用具有脱氮除磷的工艺，序批式活性污泥技术（SBR）、生物接触氧化技术或者膜生物反应器工艺（MBR）。有研究表明，通过水解酸化+SBR工艺在处理进水COD在800～2020mg/L的肉类加工废水，COD去除率高达96%，出水水质可以稳定达到《肉类加工工业污染物排放标准》一级标准。
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