该学院有：船舶海洋与建筑工程学院、机械与动力工程学院、核科学与工程学院、电子信息与电气工程学院、信息安全工程学院、软件学院、微电子学院、材料科学与工程学院、数学系、物理与天文系、化学化工学院、环境科学与工程学院、生命科学技术学院、生物医学工程学院、农业与生物学院、医学院、药学院、人文学院、安泰经济与管理学院、中欧国际工商学院、凯原法学院、国际与公共事务学院、媒体与设计学院、外国语学院、马克思主义学院、体育系、交大密歇根学院、航空航天学院、上海交通大学—上海金融学院、上海交通大学致远学院、上海交通大学创业学院、上海交大—巴黎高科卓越工程师学院、继续教育学院、国际教育学院、研究生院
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