医疗机构向卫健委提交抗菌药物备案表的申请报告流程如下：
1. 首先，需要从卫健委或相关机构获取抗菌药物备案表格。
2. 然后，根据备案表上的指导，仔细填写所有必要的信息。
3. 准备附件材料，备案表需要附带一些支持性文件和材料。
4. 一旦备案表和相关附件准备完毕，将它们一同递交给卫健委或指定的机构。
5. 跟踪进展，一旦申请报告提交，可以在一定的时间内跟踪申请进展。
以上就是医疗机构向卫健委提交抗菌药物备案表的申请报告流程。申请者在申请过程中遇到问题时，应及时向卫健委或相关机构咨询。
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