扫描电镜原理是将样品表面投射非常细小的电子束，并通过收集电子反弹或其它来源的二次电子信号来确定样品表面形态和性质。这些二次电子信号会反映出样品表面的许多细微结构和缺陷。根据二次电子的大小和散射方向能够构建出高分辨率和高对比度的三维图像。
扫描电镜是一种高精度、高分辨电子显微镜，通过对材料表面的扫描和探测进行成像，可以获取到极高分辨率的图像。由于扫描电镜对物质表面的高灵敏度，其可以用来分析小微粒、纳米颗粒及纳米结构中合金等复杂物质性质。
扫描电镜是一项非常先进的科技手段，相比其他传统技术，扫描电镜不仅具有高分辨率、高放大倍数和高对比度优势，而且可适用于非导电物、各种结构复杂的天然和合成材料，以及压电材料和纤维等物质的表面形态的重构，帮助科学家理解和探索微观的世界。
扫描电镜具体应用：
1、应用在材料科学方面
扫描电镜的应用非常重要的是材料学，可以通过对材料精细观察总结出目标物质的宏观性质或微细特征。比如利用扫描电镜进行纳米级别合成材料疲劳故障的检测、晶体缺陷分析和塑性变形的过程分析等。
2、应用在生命科学方面
在生命科学中，扫描电镜可用于细胞形态的研究以及从单细胞到微生物、植物、昆虫、小鸟等类群组织内部结构的细致解剖，以期进一步发现现实世界的奥秘。为了确保加速样品制备，在海外一些机构开展扫描电镜三维成像项目，可以对活体细胞追踪。
3、应用在地学研究和晶体学方面
使用扫描电镜技术也能对地学问题提供更深刻的认识。例如，通过扫描电子显微镜对岩石样本进行研究可以了解各种原始岩石中珍贵的化石和组织构造。作为晶体学领域的重要工具，扫描电镜可分析材料表面形态和准确发现晶格结构。
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