1、使用范围不同。
农村合作医疗的使用范围主要为医疗诊断或住院等涉及医疗而产生的保障以及报销。社保卡的使用范围涵盖了医疗保险的诊断和报销使用范围，同时还具有金融功能，同时还具有办理养老、失业等多个使用范围。
2、涵盖的险种不同。
农村合作医疗涵盖的险种为农村合作医疗保险。社保卡涵盖的养老、失业、医疗、工伤和生育等多个保险业务。
3、参保对象不同。
村合作医疗的主要参保对象为农村的农民。社保卡的发放及参保对象是在企业是单位工作且参加对应的社会保险人员。
4、享受待遇不同。
农村合作医疗的参保人员是没有个人账户的，仅有统筹账户。社保卡是带有医疗保险的个人账户，且个人账户每月由社保部门划入部分费用供参保人员就诊使用。
参考资料来源：百度百科-新型农村合作医疗
参考资料来源：百度百科-中华人民共和国社会保障卡
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