一、产权关系不同——也是本质区别
加盟店，与品牌总部是主体之间的合同关系，资本是相互的，与总部之间除了合同规定的相关细则，并无资产纽带。
直营店，则隶属于总部，属于同一资本所有，由总部直接运营、集中管理。相较而言，直营店的发展更易受到资金和人员的，但是，从另一方面讲，在新品研发、技术更新、推广应用等方面更有优势。
二、法律关系不同
加盟，是一种特许连锁方式，由特许人——品牌总部和被特许人——加盟店经合同建成关系，通过合同明确双方的权利和义务，由此，加盟店具有相对的灵活性、主动性、自主性。
直营，则是总部旗下的成员，按照总部的方针，由内部的统一管理制度进行调整，依照按总部的意志行事。
三、管理模式不同
加盟店的核心在于品牌总部对于特许经营权的转让，这一点，由初期缴纳的费用（加盟费、管理费、保证金）得以体验，品牌总部是转让方，加盟店是接受者，一个品牌可以有很多的加盟店，各自的人事和财务是相互的。
扩展资料：
连锁店优势：
1、连锁的高成功率：连锁店在全球范围内已经证明了它的成功率，它的成功率可以高达90%以上。
2、连锁大大降低学习时间，加速成功速度。投资者通过重点可以短时间的学会经营管理的经验以及知识，使得自己少走弯路，缩短自己的学习摸索时间。
3、品牌优势，投资者利用很小的投资就可以享受到长期经营的品牌和信誉，算的上市低投入高回报。同时因为使用共同的广告、促销，大大降低广告促销平均成本，有利于连锁企业树立品牌形象。
4、规模采购优势，统一采购可以使连锁经营企业同时享受大批量购买的优惠，这样不仅增强了供应商的合作力度，也降低了采购成本，很大程度节约采购成本。
参考资料来源：
百度百科-加盟店
百度百科-直营店
