海关总署是直属机构，为正部级。
海关总署的主要职责包括贯彻执行党关于海关工作的方针和决策部署，负责全国海关工作、组织推动口岸“大通关”建设、负责海关监管工作等。此外，海关总署还负责进出口关税及其他税费征收管理、出入境卫生检疫和动植物及其产品检验检疫、进出口商品法定检验、海关风险管理、国家进出口货物贸易等海关统计、全国打击走私综合治理工作等。
总的来说，海关总署是中国海关的最高领导机关，负责管理全国海关，确保国家进出口的贯彻执行，维护国家的主权和利益。
