生蚝与牡蛎在生物学上属于同类，但严格来说并不完全等同。在分类学上，生蚝是牡蛎这个大家族中的一种。不过在日常生活和饮食领域，人们常常将二者混为一谈。
牡蛎的种类繁多，全球有超过 100 种，它们形态、大小、生长环境等存在差异。生蚝是牡蛎中较为优质的品种，一般个头较大，肉质更为肥美，营养也更为丰富。生蚝的锌含量很高，每 100 克生蚝肉中锌含量可达 71.2 毫克 ，是普通牡蛎的数倍。
在烹饪方面，生蚝和牡蛎的处理方式类似。都可以生食，能最大程度保留其鲜美的口感和丰富的营养。也能进行烤、蒸、煮等烹饪，例如常见的蒜蓉粉丝烤生蚝，将生蚝撬开，加入蒜蓉、粉丝等烤制，味道十分鲜美；牡蛎则常被用来煮汤，像牡蛎豆腐汤，味道也很可口。
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