硝化菌投放后水变清澈的时间并不固定，受到多种因素影响。
如果水质污染程度较轻，水族箱等环境中生态系统相对稳定，且投放的硝化菌活性良好、数量足够，一般2 - 4天左右水可能会逐渐变清澈。在这种情况下，硝化菌能较快地开始分解水中的氨氮等有害物质，使水体的浑浊度降低。
然而，若水质污染严重，比如水中存在大量的残饵、粪便等有机物，硝化菌需要较长时间来建立优势菌群并发挥作用，可能需要一周甚至更长时间水才会变清。而且，水温、溶氧量等环境因素也会影响硝化菌的活性。适宜硝化菌生长的水温一般在25℃左右，溶氧量充足时它们的繁殖和代谢速度较快。若水温不适或者溶氧不足，硝化菌的活性受到抑制，水变清澈的时间就会延长 。详情
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