明日方舟的主线剧情一共分为八章，从序章开始，后续章节依次为：黑暗时代下、异卵同生、二次呼吸、急性衰竭、靶向药物、局部坏死、深度冻结、怒号光明，以及最新的主线章节风暴瞭望。每个章节都包含了一系列精心设计的关卡，玩家需要带领自己的干员队伍完成各种任务和挑战。这些章节不仅推动了游戏的故事发展，也展示了游戏世界的丰富多样性和角色之间的复杂关系。随着章节的更新，游戏的剧情也会不断深入，为玩家带来更多的惊喜和感动。
