山里红和山楂可以从以下几方面区分。
从植物形态上看，山里红植株比山楂更为高大，山里红树高可达6米，山楂树一般高3到5米 。山里红的叶片较大，较浅；山楂叶片相对较小，较深。
果实方面，山里红果实更大，直径可达2.5厘米左右，而山楂果实直径多在1.5厘米左右。山里红颜色更为鲜艳，通常呈深红色；山楂颜色稍淡，多为暗红色。山里红口感较甜，酸味相对较淡；山楂则酸味浓郁，甜味较少。
山里红和山楂在药用价值上也有细微差异。二者都有消食化积等功效，但山里红在活血化瘀等方面的作用稍强一些。不过在实际应用中，常常将二者通用。
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