城乡居民医疗保险余额不会每年清零。
医保个人账户余额不会每年清零，余额只有在报销医保时才会发生变动；医疗保险费的缴纳期数和金额是累计计算的。达到国家规定的累计缴费年限且劳动者达到退休年龄后，退休人员不再缴纳基本医疗保险费，但仍可按国家规定享受基本医疗保险待遇。农村合作医疗费用若当年有剩余，可结转至下一年继续使用；若中断合作医疗，仍可补交费用以恢复医保待遇。医保账户分为个人账户和统筹账户，个人账户中的资金可用于支付定点药店的药品费用、门诊和住院中的个人自付部分，这部分资金可以累积，不会自动清零。
社保的基本原则：
1、社会统筹与个人账户相结合：社保制度通常包括社会统筹基金和个人账户两部分，社会统筹基金主要用于分摊风险，而个人账户则记录个人缴费和支出情况；
2、权利与义务相对应：参保人需按规定缴纳保险费，以获得相应的社保待遇；
3、普遍性与选择性相结合：社保制度旨在为所有符合条件的人群提供基本保障，同时也允许在此基础上进行个性化选择；
4、基本保障与多层次保障相结合：除了提供基本的社会保障外，还鼓励发展补充保险和商业保险，形成多层次的保障体系；
5、责任与社会参与相结合：承担社保制度的主体责任，同时鼓励社会力量参与社保服务的提供和管理。
综上所述，城乡居民医疗保险余额不会每年清零，个人账户中的资金可用于支付药品费用和个人自付部分，且可累积使用。
【法律依据】：
《社会保险基金财务制度》
第三十六条
基金结余指基金收支相抵后的期末余额。包括企业职工基本养老保险基金结余、城乡居民基本养老保险基金结余、机关事业单位基本养老保险基金结余、职工基本医疗保险基金结余、城乡居民基本医疗保险基金结余、工伤保险基金结余、失业保险基金结余、生育保险基金结余等。职工基本医疗保险基金和城乡居民基本医疗保险基金遵循以收定支、收支平衡、略有结余的原则。新型农村合作医疗基金累计结余应不超过当年筹集基金总额的25%（含风险基金）。职工基本医疗保险基金结余包括统筹基金结余和个人账户基金结余。职工基本医疗保险基金实行分账核算、统一管理。工伤保险基金应按规定留存一定比例储备金。
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