人体耳朵的咽鼓管开口在咽部，当打哈欠或吞咽时，咽鼓管开放，就会有少量的气体进入中耳，维持鼓膜内外气压的平衡。由于咽鼓管比较短而直，感冒后，炎症极其容易波及咽鼓管，从而引起中耳炎。最终导致患者感冒时耳朵疼痛。
外耳道炎外耳道炎一般是由于细菌引起的外耳道皮肤的弥漫性炎症，常常是由于用不干净的东西挖耳朵、耳朵进水，或者各种疾病引起人体免疫力低下(例如：感冒)，所以感冒后耳朵疼可能是由于感冒引起的外耳道炎导致耳朵疼痛。
外耳道疖肿当外耳道炎症得不到及时治疗时，或者感冒发烧、年老体弱、患有糖尿病、外耳道皮肤长时间受到污水浸渍，皮肤表面抵抗力减弱，就会容易引起外耳道疖肿，随着疖肿的逐渐肿胀、化脓、耳道开始堵塞，引起疼痛。
放射性疼痛当人感冒后可能出现急性扁桃体炎、扁桃体周围炎、急性咽炎等疾病，这些疾病都可以通过咽部的舌神经，反射到耳内引起疼痛，所以很多人在感冒后会感到耳朵疼。
功能性耳痛功能性耳痛是精神疾病的一种表现，是通过各种检查均未发现引起耳痛的原因。这类耳痛一般多见于女性，通常是由于过度焦虑、过度自我在意、轻微疾病引起不适(例如：感冒)，或者是其它刺激因素引起的一种心理疾病，一般可以通过心理医生的治疗活的好转。
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