打哈欠时候肺部的二氧化碳会大量的排出，再吸入新鲜的空气，这个过程有可能会刺激到咽喉引起疼痛，尤其是咽喉有炎症的患者，比如咽喉炎、扁桃体炎，在打哈欠时候可能会出现牵扯痛，或空气刺激痛。
空气干燥在我国的秋冬时期，北方的冷空气南下，沙漠方向的风比较干燥，这时候本来就是鼻腔、咽喉等呼吸通道容易受损的时候，在咽喉干燥时候打哈欠也会引起咽喉疼痛，出现撕裂痛感。
感染疾病咽喉部位皮肤黏膜比较脆弱，很容易被菌类、病毒感染，尤其是在感染性疾病时期，多半都会伴随咽喉不适，出现咳嗽、咳血等症，这时候打哈欠便会引起咽喉疼痛。
饮食因素有部分人的饮食过于辛辣刺激，在进食时咽喉部位被严重刺激，已经出现了红肿、灼热的感觉，由于打哈欠动作较大，就会拉伤咽喉，出现打哈欠喉咙痛的现象。
上火上火的人群喉咙比较干燥，少数甚至会有些许喉咙皮肤损伤，打哈欠时候大量的吸入空气，和排出二氧化碳，若是空气干燥或带有尘埃，就会刺激到咽喉伤口，引起疼痛。
