瓜蒌含致泻物质, 有泻下作用。瓜蒌皮的泻下作用较弱;瓜篓仁所含脂肪油致泻的作用较强;瓜篓霜的致泻作用较为缓和。瓜篓乙醇提取物对幽门结扎、5-羟色胺、盐酸乙醇造成胃黏膜损伤有抑制作用, 瓜蒌乙醇提取物对乙酰胆碱造成的小鼠回肠收缩有明显的抑制作用。
抗菌瓜蒌煎剂或浸剂对大肠杆菌等革兰阴性肠内致病菌, 对葡萄球菌、肺炎双球菌、甲型溶血性链球菌、流感杆菌等均有抑制作用。此外, 对奥杜盎小芽胞癣菌及星型奴卡菌等皮肤致病性真菌亦有抑制作用。
保护心血管系统现代药理研究发现，瓜蒌仁有扩张冠脉、增加冠脉流量、抑制血小板聚集的作用，对急性心肌缺血有明显的保护作用。
抗癌体外实验证明：瓜蒌煎剂及瓜蒌皮和瓜蒌仁的提取物对小鼠腹水癌细胞有杀灭作用。瓜蒌皮的体外抗癌效果比瓜蒌仁好, 且以60%乙醇提取物作用最强。从瓜蒌皮的醚浸出液中得到的类白色非晶体性粉末亦有体外抗癌作用, 而子壳和脂肪油均无效。动物实验表明：瓜蒌对肉瘤有一定的抑制作用, 但对腹水癌的作用不明显。
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