扁蓄有利水通淋的作用，用于湿热淋证，可治疗泌尿系感染、结石、血尿等。用于湿热下注、热淋涩痛等症，可与瞿麦、滑石、木通、车前子、栀子、甘草等同用。
扁蓄有杀虫止痒的作用，可治疗蛲虫等寄生虫病。亦可煎汤外洗治疗皮肤疮疹、瘙痒。治胆道蛔虫症，可用萹蓄和醋的功效与作用，加水煎服。
扁蓄水及醇提取物能加速血液凝固，使子宫张力增高，可用作流产及分娩后子宫出血的止血剂。
1：10的扁蓄浸出液，试管内对某些真菌有抑制作用，对细菌的抑制作用较弱。
