1、穿心莲采收后运回摊晒在太阳下晒至5-6成干，把它扎成小把再晒至足干，捆成大把。药材打捆后宜贮藏于通风干燥处。
2、穿心莲采收时间和药效关系很密切，适时采收，有效成分含量高，一般是从栽培后75～90天，宜在10月份植株出现蕾初花期采收为最佳时间。最迟不能迟于果期。每年采收一造，宜在10月份现蕾初花期采收。每年采收两造则在8月和11月份采收。穿心莲采收的时候，一般选择晴天。在收割时要齐穿心莲的根部下刀，整体切割下来。
