柴犬的平均寿命一般是在12-15年，除了白内障以及髌骨脱位以外，基本上没有其他重大的遗传病，因此寿命属于犬类的中等水平。但为了避免遗传病的发作，延长柴犬的寿命，最好还是给它进行定期体检，尤其是眼睛和骨骼的检查需要重视，一般来说如果你的柴犬已经过了2岁，但是没有发现重大的关节疾病，那么基本上就能够放心，因为这个时候它的骨骼已经发育成熟了。
柴犬总体上来说，还是属于比较健康的品种，因为它是日本土生土长的犬种，因此基因基本稳定，不会出现重大缺陷，而且它对于环境的适应力，相较于其他犬更强，皮实好养，除了一点，就是它的脾气比较倔强，因此在外出时，动不动就会嫌累，赖在原地就不起来，有时拉都拉不动，还是很让人头痛的。
如果你想要让柴犬活的更久，除了给它做好饮食、医疗等方面的工作，还可通过绝育来减轻它患上生殖癌或是其他免疫性疾病的风险，据调查，绝育后的狗狗年龄普遍提高了2-3岁。