制度性留抵退税的意思是对现在还不能抵扣、留着将来才能抵扣的“进项”，予以提前全额退还。
留抵退税就是把期末未抵扣完的税额退还给纳税人。实行链条抵扣机制，以纳税人当期销项税额抵扣进项税额后的余额为应纳税额。其中，销项税额是指按照销售额和适用税率计算的额；进项税额是指购进原材料等所负担的额。当进项税额大于销项税额时，未抵扣完的进项税额会形成留抵税额。
留抵退税形成的原因？
主要是纳税人进项税额和销项税额在时间上不一致造成的，如集中采购原材料和存货，尚未全部实现销售；投资期间没有收入等。此外，在多档税率并存的情况下，销售适用税率低于进项适用税率，也会形成留抵税额。