1.How to initiate SOS system(15)?

2.Illustrate the mechanism of forming of pppGpp and ppGpp？

答：1.当细菌发现它们处于很差的生长环境，没有足够的氨基酸来维持蛋白质合成时，它们就会停止大部分活动，这种现象称为应急应答。应急应答产生两种非正常的核酸堆积物，即pppGpp and ppGpp。

2.在应急条件下，空载体tRNA进入核糖体A位，从而引发一个无效反应。位于A位和P位附近的relA基因产生RelA这种蛋白应急因子，这种因子作为催化反应酶催化ATP，使其焦磷酸转移到GDP或GTP上。从而产生pppGpp and ppGpp。一般情况下，RalA酶更倾向于以GTP为底物，所以pppGpp是主要产物。pppGpp在翻译因子EF-T u和EF-G的作用下去磷酸化，生成ppGpp。

3.当条件转为正常的时候，有stpT基因编码的酶催化作用下，迅速降解ppGpp，应急应答反应停止。

3.Describe the mechanisms of transposition for Tn10in detail(16,530).

T10的转座属于非复制型转座。转座单元作为实体，直接从一个位点转到另一个位点，并且是保守的。在转座酶的作用下，TN10释放，同时，靶序列上造成交错断裂，然后转座子与单链末短结合，填补缺口后接完成了转座。

4.Try to distinguish methylated and nonmethylated please(21347)?

5.What reaction can explain Agrobacterium infection succeeds only on wounded plants(P594,Cha 18)?

6.Try to explain the properties of the monomeric G-protein via example please(such as Ras or Ran)(Ras P929,Ran P257(8),EF-Tu P1(6),Ran P982)?

7.What proteins are given through processing of retroviral genes?(17,555)

主要产生三种蛋白：Gap多聚蛋白质，Pol多聚蛋白质和Env多聚蛋白质。其中，前两种由全长mRNA翻译而成，而后者是病毒通过剪接产生一种亚基因组的信使RNA，然后将其翻译成Env产物。

gap基因产物组成病毒颗粒的核蛋白核心，pol基因产物的主要功能是核酸合成和重组，而env 基因的主要是编码病毒颗粒的外壳蛋白。

8.How to initiate each Okazaki fragment?(14，444)DNA的复制时半不连续的方式合成的。在DNA的合成是从N端-C端合成的，然而，DNA 的双链的方向刚好相反。所以，前导链在复制过程中可以连续复制，而后随链的复制要从N 端-C端，必须一段一段的复制，这些一段一段的复制片断就叫冈崎片断。

9.What is conjugation?(13)

Conjugation is a process in which two cells come in contact and exchange genetic material.In bacteria,DNA is transferred from a donor to a recipient cell.In protozoa,DNA passes from each cell to the other.

接合是两个细胞相互交流交换遗传物质的一个过程。在细菌的接合是DNA从供体菌到受体菌。原生动物中的接合是DNA从一个细胞转到另一个细胞。

10.How to change(form)the state of lysis and lysogeny for phage(in detail)?(12，395)

答：当细菌生长在丰富培养基上时，降解cⅡ蛋白的宿主蛋白酶是有活性的，于是PRE的作用被停止，不能通过PRE使基因cⅠ合成阻抑物：另外，此时Cro蛋白在OR3处结合，停止了在PRM处开始的溶源维持回路，也不能合成阻抑物。即这时候Cro蛋白占据了操纵子，所以，此时噬菌体进入裂解周期。

当细菌处于饥饿状态时，降解cⅡ蛋白的宿主蛋白酶是没有活性的，于是，cⅡ蛋白通过PRE 使基因cⅠ合成阻抑物：另外，Cro蛋白在OR1和OL1处结合，这样立即伴随着阻抑物在在OR2和OL2处的协同结合，从而关闭了Cro蛋白的合成并开始了经由PRM进行阻抑物的合成。即这个时候阻抑物占据了操纵基因，所以噬菌体进入溶源化。

11.Give the example to describe RNA interference(RNAi and micro RNA etc).(11)

答：利用RNAi技术研究p53基因表达。以质粒为载体，介导体外合成具有与p53基因目的区域同源的DNA片段，通过脂质体将携带此片段的质粒载体导入肿瘤细胞，利用质粒载体U6-RNA启动子不断在体内产生21-23nt的siRNA,在体内，它被组装成无活性的蛋白复合体，即RNA诱导的沉默复合体，在APT作用下，双链siRNA解链成单链RNA，在它的指导下，核酸酶识别并切割与siRNA互补的P53基因，使表达量下降或者失去，达到沉默的作用，从而研究其功能。

12.Attenuation（衰减作用）can be controlled by what(in details)?(10，360)

答：衰减作用可以被翻译所控制。

色氨酸操纵子的前导区有一个由14个密码子组成的可读框，其中包含编码色氨酸的两个密码子。当存在色氨酸时候，前导序列被翻译，使得衰减子形成法家结构，这个发夹结构引起转录终止。当不存在色氨酸的时候，核糖体停在色氨酸密码子处，衰减子的二级结构阻止了发夹结构的生成，转录得以继续。

13.How does glucose inhibit the transcription(by cAMP,CAP)?(10，11，344)答：细菌对各种潜在的碳源具有潜在的偏好，当葡萄糖作为一种可以用的能量来源时相对其他糖类，它被优先利用。当大肠杆菌培养基中发现葡萄糖和乳糖的时候，葡萄糖优先进入细胞，使单糖磷酸转移酶系统（PTS）中的蛋白质ⅡAGlc脱磷酸化，然后它结合乳糖通透酶，乳糖不能进入细胞，于是阻抑物关闭操纵子。蛋白质ⅡAGlc脱磷酸化导致腺甘酸环化酶活性降低，于是控制大肠杆菌操纵子的激活剂CAP蛋白失去作用，不能激活转录。从而抑制了转录。

14.To illustrate cascade（σ因子）.(9)

答：σ因子和核心酶共同组成全酶，在转录的时候起催化作用。转录开始的时候σ因子和核心酶共同作用，识别并催化转录，转录进行8-9个碱基的时候，σ因子脱离全酶。σ因子有多种类型：

σ70，普通通用因子；

σS，张力

σ28σF，鞭毛基因的表达；

σ32，热激基因的转录；

σE，热激；

σ54，氮的利用

15.How does P factor work?(9)

答：P因子是大肠杆菌的一种基本蛋白质，只在终止阶段发挥作用，由6个相同亚基组成。亚基具有一个RNA结合域和ATP水解域。它作为RNA聚合酶的辅助因子行使其功能。

P因子最初结合到RNA终止子上游一个伸展的单链区，然后发挥它的ATP酶活性以提供在RNA上滑动的能量，沿RNA伸展的方向滑动直到RNA-DNA杂合的终止子区域，然后发挥解螺旋的作用，使双链体结构解开。

16.Describe the components of the translocon and their functions.(8)

答：A translocon is a discrete structure in a membrane that forms a channel through which (hydrophilic)proteins may pass.

易位子是镶嵌在内质网等膜性结构内的一种水溶性跨膜通道。它帮助跨膜蛋白通过脂质双层膜结构。它主要成分是Sec61复合体，它包括三种跨膜蛋白αβγ。

17.Give the example to describe suppressor tRNAs compete with wild-type tRNAs that have thesame anticodon to read the corresponding codon(s).(7，206)

答：野生型翻译的时候，蛋白质的翻译终止于UAG终止密码子，然而，琥珀抑制子tRNA 能够与释放因子竞争性的识别终止子UAG密码子，使蛋白质的合成通过终止子继续阅读。

18.Describe Eukaryotic initiation.(6)

1.40s小亚基结合到mRNA的5’帽子结构

eIF-2——Met-tRNAi——GTP形成三元复合体，与游离的小亚基结合形成43s复合体，与mRNA的5’帽子结构结合。

2.40s小亚基在mRNA上移动，找到起始密码子

eIF1和eIF1A辅助43s起使复合体扫描mRNA直到AUG起始密码子，然后eIF2和eIF3释放。

3.40s小亚基与60s大亚基结合

eIF5B的作用下，介导60s亚基与复合体结合形成可以延伸的核糖体。

19.How to separate satellite DNA?

对DNA进行密度梯度离心，即因子中大部分DNA形成连续的片断群，这一片断群形成一个较宽的峰，以基因组平均GC含量相对应的浮力密度位置为中心，称为主带；在不同密度值处看到另外一个或多个较小的峰，就是卫星DNA。另外，利用复性杂交的方法，也可以分离出来。

20.Which test displays Mendelian segregation at the level of DNA marker fragments.(2)

1.RFLP Restriction Fragment Length Polymorphism---性片段长度多态性，是指用某种性内切酶切割来自不同个体的基因组DNA或某个基因，会得到不同长度的DNA片段，表明在这种被切割的来自不同个体的DNA分子上内切酶的识别序列有差异。

2.AFLP Amplified Fragment Length Polymorphism---扩增片段长度多态性，相对与RFLP 而言,在AFLP分析中显示多态性的DNA片段不是由于性内切酶酶切基因组DNA而产生,而是通过DNA多聚酶链式反应扩增基因组DNA模板而产生的。

由于不同物种或品种的基因组DNA序列差异很大，在复制特定的DNA序列时所需要的引物核苷酸序列也不同，同一引物可能使某一品种的DNA片段得以复制，而在另一品种中可能无法诱导。如此将引物所诱导复制的特定DNA片段采用PCR技术扩增，再进行电泳分离，就可以区分出不同物种或品种之间的多态性。

3.RAPD Random Amplified Polymorphism DNA--RAPD随机扩增多态性DNA。

实际上RAPD是一种特殊形式的AFLP，区别在于扩增多态性DNA所用的引物是随机的，而不是专一的。

RAPD所用的一系列引物序列各不相同，但对于任一一对特定引物，它同基因组DNA序列的结合又是特定的。

用一组引物（20-40个）在基因组全序列上扫描可以获得基因组多态性丰富的信息。

如果引物长度为10个碱基，排列方式有4

4.STMS(Sequence-tagged microsatellites)：通常又称为SSR，也可称为SSRP(Simple Sequence Repeat Polymorphisms)

基本原理:引物根据与微卫星重复序列两翼的特定短序列设计，用来扩增重复序列本身。由于重复的长度变化极大，所以这是检测多态性的一种有效方法。

SCAR(Sequence-characterized amplified regions)

SCAR标记是在RAPD技术的基础上发展起来的。其基本步骤是：先作RAPD分析，然后把目标RAPD片段（如与某目的基因连锁的RAPD片段）进行克隆和测序，根据原RAPD 片段两末端的序列设计特定引物（一般比RAPD引物长，通常24个碱基），再进行PCR特异扩增，这样就可把与原RAPD片段相对应的单一位点鉴定出来。这样的位点就称为SCAR。SCAR比RAPD和其它利用随机引物的方法在基因定位和作图中的应用更好，因为它有更高的可重复性（原因是使用的引物长），标记是共显性遗传的

5.CAPS(Cleaved amplified polymorphic sequence)

CAPS技术又可称为PCR-RFLP。所用的PCR引物是针对特定的位点而设计的。其基本步骤是：先进行PCR扩增，然后将PCR扩增产物用性内切酶酶切，再用琼脂糖凝胶电泳将DNA片段分开，用EB染色，观察。与RFLP技术一样，CAPS技术检测的多态性其实是酶切片段大小的差异。在酶切前进行PCR产物检测，其多态性称为ALP。

6.SNP单核苷酸多态性（single nucleotide polymorphism，缩写SNP）技术

同一位点的不同等位基因之间常常只有一个或几个核苷酸的差异，因此在分子水平上对单个核苷酸的差异进行检测是很有意义的。目前SNP作为一种新的分子标记，已有2000多个标记定位于人类染色体上，在植物上也在进行开发研究。可在胶上也可不在胶上就能检测出SNP，但检测SNP的最佳方法是新近发展起来的DNA芯片技术下载本文