一、 名词解释(1-5 题中任选4 道,先翻译成英文再解释;6-10 题中任选4 道,先翻
译成中文再解释。每题5 分,共40 分)
1. 翻译
Translation
在核糖体内,转录后加工成熟的mRNA 以密码子为单位编码出与mRNA 碱基序列所对应的多
肽链的过程,包括起始、延伸和终止三个过程。
2. 核小体
Nucleosome
染色质(或染色体)的基本组成单位,由DNA 环绕组蛋白构成,组蛋白为多聚物,包括H1×1,
H2A ×2, H2B ×2,H3 ×2, H4 ×2。这些蛋白的N 末端暴露在核小体的外部,有利于组蛋白
的修饰(如甲基化、甲酰化等),从而对基因表达进行。
3. 启动子
Promotor
在 DNA 转录起始时RNA 聚合酶识别并与其结合的一段DNA 片断,一般不编码蛋白,具
有与RNA 聚合酶结合位点,并引导转录的开始。
4. 增强子
Enhancer
真核DNA 上一段特殊的片断,其能通过一些转录因子介导增加启动子的使用频率,即增加
转录的频率。它可以位于启动子的上游,也可以在其下游。
5. 转座子
Transposon
一段两端具有反向重复序列的DNA 片断可以从原位上单独复制或断裂下来,插入另一位
点,并对其后的基因起作用,此过程称转座。这段序列称为转座子,可分插入序列、
复合转座子和TnA 家族。
6. Shine-Dalgarno Sequence
SD 序列
原核mRNA 中5'端富含嘌呤的短核苷酸序列,一般位于mRNA 的起始密码AUG 的上游5~10
个碱基处,并且同核糖体小亚基上的16S rRNA 3'端的序列互补,能够使核糖体准确的识
别到翻译的起始位点。
7. Ribozyme
核酶
核酶一词用于描述具有催化活性的RNA, 即化学本质是核糖核酸(RNA), 却具有酶
的催化功能。核酶的发现对于所有酶都是蛋白质的传统观念提出了挑战。
8. Ubiquitin
泛素
泛素是一种 76 氨基酸的多肽,可以在三种酶(E1,E2, E3)的催化下共价连接到把蛋
白的Lys ε-NH2,并进一步通过多泛素化,介导靶蛋白被蛋白酶体降解。
9. Single nucleotide polymorphism (SNP)
单核苷酸多态性
主要是指在基因组水平上由单个核苷酸的变异所引起的DNA 序列多态性。它是人
类可遗传的变异中最常见的一种。占所有已知多态性的90%以上。SNP 在人类基
因组中广泛存在,平均每500~1000 个碱基对中就有1 个,估计其总数可达300
万个甚至更多。
10. Nonsense Mutation
无义突变
一种编码某一氨基酸的三联体密码经碱基替换后,变成不编码任何氨基酸的终止密码
UAA、UAG 或UGA 的突变。虽然无义突变并不引起氨基酸编码的错误,但由于终止密码出
现在一条mRNA 的中间部位,就使翻译时多肽链的终止就此终止,形成一条不完整的多肽
链。
二、简答题(任选4 道,每道6 分,共24 分)
1. 简述核糖体中主要的活性位点及其功能。
答:核糖体中的主要活性位点为:
1) A位点:氨酰tRNA 结合位点,在肽链延长过程中与进入的氨酰tRNA 结合;
2) mRNA 结合位点:位于30S 亚基的头部,在原核中与mRNA 上的SD 序列结合,
在真核中识别并结合mRNA 的5’帽子;
3) P位点:肽酰tRNA 位点,与携带新生多肽链的tRNA 结合,位于30 和50S 亚
基;
4) E位点:离开位点,空载的tRNA 从此位点被排出,位于大亚基;
5) 肽基转移酶活性位点:位于 50S 亚基, P 位和A 位之间,催化肽基转移到氨酰
tRNA;
6) IF 结合位点和 EF 结合位点:与起始因子和延伸因子结合。
2. 简述端粒酶的作用机理和功能。
答:端粒酶是一种核糖核酸蛋白酶,由RNA 和蛋白质构成,具逆转录活性,能够以
自身的结构RNA 为模版,通过多次互补配对,延长端粒3’末端。之后合成引物,使5’
端也得到延长。
功能:由于在复制过程中存在末端丢失,通过端粒酶的作用保护了染色体末端,同
时使得端粒的得到延伸,防止端粒过短影响复制。
3. DNA 修复的主要机制有哪些?
答:DNA 修复主要机制有7 种:
1) 正读码机制,依靠 DNA 聚合酶切除错误核苷酸,替换正确核苷酸;
2) 错配修复系统,依靠mut 基因编码的蛋白,特异性识别切除包含错误核苷酸的一
段多核苷酸链,再由DNA 聚合酶Ⅲ重新合成;
3) 光复活作用,通过修复酶(光裂化酶)直接逆转紫外辐射造成的嘧啶二聚体结构;
4) 碱基切补修复,糖基化酶将碱基移除,而后由核苷酸内切酶进行补切修复;
5) 核苷酸切补修复,将受损伤的一段核苷酸切除,合成新的核苷酸替换错误片段;
6) 重组修复,通过从受损DNA 找回序列信息来修复DNA 断裂,当DNA 两条链都
受损时采用这种方式;
7) SOS 应答,当DNA 受到放射损伤或其它较大损伤时,形成特化的DNA 聚合酶催
化,此酶越过损伤部位直接合成DNA
4. 简述 Ames Test 的原理和意义。
答:突变回复是指由突变性状(缺陷型)重新恢复为野生性状的突变过程。Ames test
就是以肝脏原浆模拟体内环境,利用突变回复来检测诱变剂和致癌剂。缺陷型菌株(如
his-)不能在缺乏相应成分的(His-)的培养基中生长,而野生型菌株能。正常情况下
菌株的突变几率很低,所以缺陷型回复为野生型菌株的几率就很小,在培养基中(His-)
不能生长。但若加入诱变剂或是致癌剂后,能大大提高突变几率,这样就使部分缺陷型
菌株恢复为野生性状,能在培养基上生长(His-)。反之,若加入的不是诱变剂或致癌剂
则菌株依旧未缺陷型,不能在培养基上生长。
5. 简述 PCR 的原理。
聚合酶链式反应(Polymerase Chain Reaction),简称PCR,是一种在生物体外进行DNA
复制的分子生物学技术。
DNA 的半保留复制是生物进化和传代的重要途径。双链DNA 在多种酶的作用下可
以变性解链成单链,在DNA 聚合酶与启动子的参与下,根据碱基互补配对原则复制成同
样的两分子挎贝。在实验中发现,DNA 在高温时也可以发生变性解链,当温度降低后又
可以复性成为双链。因此,通过温度变化控制DNA 的变性和复性,并设计引物做启动子,
加入DNA 聚合酶、dNTP 就可以完成特定基因的体外复制。
PCR 过程分为三步:①DNA 变性(90℃-96℃):双链DNA 模板在热作用下, 氢键
断裂,形成单链DNA. ②退火(25℃-65℃):系统温度降低,引物与DNA 模板结合,形
成局部双链. ③延伸(70℃-75℃):在Taq 酶(在72℃左右最佳的活性)的作用下,以
dNTP 为原料,从引物的5′端→3′端延伸,合成与模板互补的DNA 链。每一循环经过
变性、退火和延伸,DNA 含量既增加一倍。这样通过对温度变化的循环控制完成DNA
的持续复制。
三、翻译(共 10 分)
Translation takes place in three principal steps: initiation, elongation, and termination.
Eukaryotic mRNAs recruit (招募) the small subunit through recognition of the 5’-cap and the
action of numerous auxiliary ( 辅助的)initiation factors. The small subunit scans
downstream until it encounters (遇到)an AUG, which it recognizes as the start codon.
Translation terminates when the ribosome encounters a stop codon, which is recognized by
one of two class I release factors in prokaryotes (RF-1 and RF-2) and a single class I release
factor in eukaryotes (eRF-1). The release factor triggers (触发)the hydrolysis of the
polypeptide from the peptidyl-tRNA and hence the release of the completed polypeptide.
翻译的发生可分为三个基本过程:起始、延伸和终止。真核mRNA 通过5’帽子的识别
作用和大量辅助起始因子的介导与核糖体小亚基结合。结合后,小亚基向下游移动直到
遇到起始密码子AUG;当核糖体遇到终止密码子后翻译便停止。在原核生物中终止密码
子被两种I 型释放因子(RF-1 and RF-2)中的一个来识别;在真核生物中终止密码子能识别
被一种释放因子(eRF-1)来识别。这些释放因子能触发多肽从肽酰-tRNA 上水解下来,并
促进完整地多肽的释放。
四、问答题 (共18 分)
1. 阐述乳糖操纵子的组成及其机制。(8 分)
乳糖操纵子由基因lacI 、操纵基因和三个结构基因lac Z、lacY、lacA 组成。
lacZ 编码β-半乳糖苷酶,它可以切断乳糖的半乳糖苷键,而产生半乳糖和葡萄糖。lacY
编码β一半乳糖苷透性酶,它构成转运系统,将半乳糖苷运入到细胞中。lacA 编码β-半
乳糖苷乙酰转移酶,其功能只将乙酰-辅酶A 上的乙酰基转移到β-半乳糖苷上。
Lac 操纵子的分为正和负两种。lacZ、Y、A 基因的转录是由lacI 基因
指令合成的阻遏蛋白和cAMP 与其结合蛋白CAP 所控制的。机体内没有乳糖时,lacI 编码
的阻遏蛋白与操纵基因结合而占据RNA 聚合酶的结合位点,阻止了转录的进行;存在乳
糖时,乳糖分子与阻遏蛋白结合,阻碍了阻遏蛋白与操纵基因结合,转录的抑制解除。
如果体内缺少葡萄糖,cAMP 的形成增加,并与CAP 结合,cAMP-CAP 与操纵基因结合并引
导RNA 聚合酶与启动子结合,加强了转录过程;如果体内有葡萄糖,cAMP 的含量降低,
CAP 对转录的促进作用消失。乳糖操纵子通过阻遏蛋白的负和cAMP-CAP 的正的
综合作用完成基因的
2. 简述原核蛋白质(多肽)生物合成的过程。(10 分)
原核多肽的生物合成可分为起始、延伸和终止三个过程。
起始过程:在IF3 与小亚基结合,使小亚基处于游离状态;IF1 与小亚基A 位点结合,
阻止起始tRNA 进入A 位点;mRNA 通过起始密码子上游的SD 序列与核糖体小亚基上16S
rRNA 3’端序列的互补配对使得核糖体的P 位点正好处于起始密码子处。IF2 将起始氨酰
-tRNA(fMet-tRNAi
fMet)引入P 位点;IF3 和IF1 离去后,核糖体大亚基与小亚基结合形
成翻译起始复合物。
延伸过程:EF-TU不断地利用GTP 将氨酰-tRNA 引入A 位点,而EF-TS则负责将EF-TU-GDP
变成EF-TU-GTP,再次行使功能。通过转肽反应,将P 位点的肽酰-tRNA/氨酰-tRNA 上的
多肽或氨基酸转移到A 位点氨酰-tRNA 的氨基端,从而产生延长一个氨基酸的肽酰-tRNA;
EF-G 促进移位反应,将转肽反应生成的肽酰-tRNA 从A 位点转移至P 位点。这样核糖体
每向前移动三个碱基的位置就编码出了一个氨基酸,空载的t-RNA 从E 位点时放出。
终止过程: 当核糖体移动到终止密码子时,释放因子RF1( UAA、UAG)或RF2 (UAA、
UGA)进入A 位,可以识别终止密码;RF3 RF-3 激活RF-1 和RF-2,催化多肽链从肽酰
-tRNA 上释放,同时促进RF-1 和RF-2 的释放。之后, RRF 与EF-G 协同作用,使核糖体
大小亚基分离;IF3 与小亚基结合,被用于下一翻译过程。
释放出的多肽经过一系列的加工过程(折叠、糖基化等),形成成熟的蛋白并在机体
内行使特定的功能。
五、综合测试 (共8 分)
分子生物学中最常用的载体是质粒(一种双链环状DNA)。根据你所掌握的分子生物学
知识,分别设计一个真核表达质粒(I)和一个原核表达质粒(II)。
3 4 6 7
5 5 8
6
2
(Ⅱ) (Ⅰ)
4
1 3 1
2
在(Ⅰ)中:
1:真核基因的复制起始序列,ARS;
2:真核细胞筛选标记;
3:原核基因的复制起始序列,OriC;
4:原核细胞筛选标记,如ampr 等;
5:真核启动子;
6:增强子;
(II) (I)
7:多克隆酶切位点,MCS;
8:转录终止序列,包括polyA 加尾信号。
在(Ⅱ)中:
1:原核基因的复制起始序列,OriC;
2:原核筛选标记,如ampr 等;
3:强的启动子,如Lac 启动子,包括了相关操纵子;
4:SD 序列;
5:多克隆酶切位点,MCS;
6:转录终止序列下载本文