纯化
1.配制培养基LB, 挑取菌种至含有抗生素的LB液体培养基中(50ml+1管菌种),37 ℃ 220 rpm培养。
2.取10mL培养的菌液转接到1000 mL新鲜的LB抗性培养基中,37 ℃ 220 rpm培养至OD600≈0.4-0.5。
3.将培养箱温度调至20℃,转速调至180rpm,继续培养约0.5h-1h(取出1mL菌液作为诱导前对照)。之后加入1 M IPTG至终浓度为0.1-1 mM(本次实验的浓度为0.1mM),继续诱导培养大约9-10小时(取出1mL菌液作为诱导后对照)。
4.4℃,4000rpm离心,15min收集菌体。沉淀可冻于-80℃保存(做蛋白结晶尽量不要冻存)。
5.配制buffer A,如下
| Component | Final concentration | Per liter | 100mL |
| 1.0 M Tris-HCl,pH 8.0 | 20mM | 20mL | 2mL |
| NaCl(5M) | 100mM | 20mL | 2mL |
| pH 8.0 |
7.混匀后冰上放置20Min,期间不时的震荡。混合物使用液压破碎(比超声破碎好)。
8.离心10000rpm,4℃,45min,彻底去除菌体碎片,取上清备用。(一定不要菌体碎片!取4ul+4ulLB 作为binding前的对照)
9.Ni beads的预处理:取适量beads,加入适量的buffer A,如800uL beads(1000mL菌液沉淀)加入1mL buffer A,800rpm,2.5min,洗3次。
10.将步骤6所得的上清与预处理好的beads加入50mL的离心管中,封口膜封口后,静音混匀器4℃binding1-2h(时间过长蛋白易降解)。
11.将binding后的溶液过柱(取4ul+4ulLB 作为binding后的对照),加入10CV wash buffer,放置10min后冲洗(取4ul+4ulLB 作为wash后的对照)。
Wash buffer: buffer A+20mM imidazole
12.洗好的beads加入适量(5CV)的elution buffer, 放置10min后洗脱。为了确保蛋白全部洗脱下来,可以边洗脱边用考马斯亮蓝法检测蛋白,当不再变蓝时,就不用再洗脱了。
Elution buffer:buffer A+250mM imidazole (imidazole 浓度高时,用浓HCl调pH值)
11. elution 后的蛋白分装成50-100uL/管,冻于-80℃,避免反复冻融。取5-10uL电泳检测蛋白表达量。
蛋白浓缩步骤:
将提纯的蛋白加入浓缩管中(10),3000g,4℃,第一次离心10min(用bradford检测废液中是否有蛋白)。边离心边检测, 至终体积约为700uL。用200uL吸出蛋白,注意不要碰到膜,检测蛋白的终浓度。
FPLC
1、用buffer A 平衡分子筛,flow rate: 0.5; pressure <1.2,时间大约1h。
2、将浓缩好的蛋白离心5min,上清用注射器加入进样孔。
3、收集峰值很好的蛋白,取出跑电泳,染色,检测是否有目的条带,纯度如何。
4、选取纯度最好的蛋白,浓缩后测量浓度,计算得率。
5、若蛋白浓度和纯度达到标准,即可进行结晶实验。
上样:
Pump flow 0.5ml/min insert
Flowpath inject
Alarm alarm pressure <1.5Mpa
Fraction size 0.5ml
End time acu volume 25ml
Execute
A 泵放水中,pump wash pump A insert
DLS(动态光散射)
判断纯化蛋白的分子量大小。
结晶蛋白
TIPS:
1、Lysis buffer 多加一点, 50mL/L 菌。
2、离心时间长一点 45min 10000rpm
3、5个柱体积洗beads
4、Binding 1h. Binding后先倾斜放,等beads 沉下去后把beads先吸到预装柱里,再把上清加进去。
5、10个柱体积wash, 注意不要破坏柱床。
6、5个柱体积洗脱。一般第二次最浓,边洗脱边用Bradford检测,不变蓝就不用再洗脱了。 1ml+1ul蛋白 变色?
7、浓缩<3000g(千万不要超过),一般用3500rpm 就可以了。下载本文